Charles Wijnker studeerde Economie aan de Universiteit Maastricht. Hij begon zijn loopbaan bij De Nederlandse Bank en het ministerie van Financiën. Hier was hij onder meer afdelingshoofd Financiële markten. Van 2014 tot 2017 werkte hij als directeur Arbeidsmarkt en Sociaal-Economische Aangelegenheden bij het ministerie van Sociale Zaken en Werkgelegenheid. En van 2017 tot 2021 was Charles plaatsvervangend directeur-generaal Volksgezondheid en directeur Voeding, Gezondheidsbescherming en Preventie bij het ministerie van Volksgezondheid, Welzijn en Sport. Het laatste jaar nam hij ook waar als directeur-generaal Volksgezondheid.